Streptavidin 鏈霉親和素及偶聯物是四聚體蛋白，大小為66KDa。一分子鏈霉親和素可以高度特異性地與四分子生物素結合，兩者之間的親和力極為強烈，Streptavidin 鏈霉親和素及偶聯物-生物素復合物的解離常數處于 10 mol/L 數量級，這一性質常用于分子生物學用途 。其中一條完整的SA肽鏈中有159個氨基酸殘基，分子量為16450。
消光系數與蛋白中Tyr含量有關， 由于SA 中Tyr的含量比AV 多，所以SA的比消光系數也較AV 為高，兩者分別為E 1mg/mL=3.40和E1mg/mL=1.57。在282nm 上這兩種蛋白結合生物素后并不改變其消光系數，而在233nm上，它們結合生物素后郡便其消光系數值增高，現在一般都是利用蛋白的這種吸光特點來測定它們的活性。
Streptavidin 鏈霉親和素及偶聯物分子由4條相同的肽鏈組成，其氨基酸組成中，甘氨酸和丙氨酸的含量較大，而且結合生物素的活性基團也是肽鏈中的色氨酸殘基;鏈霉親和素是一種稍偏酸性(pH6.0)的蛋白質，并且不帶任何糖基。在蛋白水解酶作用下，鏈霉親和素可在N端10～12和C端19-21間斷裂，形成的核心鏈霉親和素仍然保持完整的結合生物素的能力。Streptavidin 鏈霉親和素及偶聯物的活性單位也是以結合1μg生物素所需的量來表示，1mg鏈霉親和素的zui高活性可達18U。